Inicialmente as panículas emergem com grãos manchados de coloração marrom-avermelhada surgindo na extremidade apical e se espalhando por todo o grão.  O fungo produz colônias sobre sementes com estruturas de cor branca ou cinza.

Quando o ataque ocorre após a emergência das panículas, as manchas típicas aparecem com o centro claro durante a formação dos grãos.  Quando em condição de alta umidade pode ser visualizado uma massa composta por estruturas de reprodução do fungo sobre as manchas. Quando o ataque é severo, os grãos podem se apresentar parcialmente formados.

A doença é observada nos grãos, ocorre a formação de uma massa arredondada de coloração que varia de verde a laranja. Esta massa apresenta aspecto que aparenta ser coberto de pó e pode ser de tamanho variável. Pode também se manifestar como uma massa de tamanho reduzido contida pelas glumelas.

O sintoma inicial desta doença é a murcha suave e parcial da planta nas horas mais quentes do dia. As folhas mais velhas ficam amareladas e necrosadas nas bordas, em forma de "V" invertido. Os frutos ficam pequenos e mal formados. Na região do colo do caule, ocorre leve necrose vascular, não tão intensa quanto a causada por F. oxysporum f. sp. lycopersici.

Nas plantas doentes ocorre a murcha das folhas superiores, principalmente nas horas mais quentes do dia. As folhas mais velhas ficam amareladas e pode ser observada murcha ou amarelecimento em apenas um lado da planta ou da folha. Os frutos não se desenvolvem, amadurecem ainda pequenos e a produção é reduzida. Ao cortar o caule próximo às raízes, verifica-se necrose do sistema vascular. 

Os sintomas aparecem na fase reprodutiva do tomateiro. A doença é observada em reboleiras, identificada pela seca prematura da planta. O fungo causa "mela" das folhas e das hastes e, com o amadurecimento da planta, o caule apresenta uma podridão seca, cor de palha, contendo, em seu interior, estruturas do fungo em forma de grânulos pretos, semelhantes a fezes de rato. Os frutos permanecem fixados à planta doente e raramente apresentam sintomas de podridão.

As plantas doentes podem apresentar podridão mole e aquosa. Há crescimento de mofo de coloração branca (semelhande a fios de algodão) na superfície dos tecidos afetados. Pode ocorrer também a formação de pequenos grânulos de cor marrom-clara (estruturas do fungo). Os sintomas são comuns nas folhas, hastes e frutos, que ficam em contato direto com o solo.

Apresentam sintomas típicos de galhas, massas de ovos de nematoide associados nas raízes. As plantas apresentam sintomas visíveis na parte aérea que é pouco desenvolvida e as plantas apresentam baixo vigor.

Ocorre a murcha da planta, de cima para baixo, a partir do início da floração, mas as folhas permanecem verdes. A parte inferior do caule se torna amarronzada e ocorre a migração de um pus bacteriano para fora quando se faz o "teste-do-copo".

Como fazer o teste do copo?

Corte um pedaçõ de caule da planta suspeita em um copo com água. Em caso positivo, observa-se a migração de um pus bacteriano da planta para água como n aseguinte imagem:

A requeima é caracterizada por manchas encharcadas, grandes e escuras nas folhas e nas brotações. Na face inferior da lesão nas folhas, geralmente observa-se um mofo esbranquiçado. Nos frutos, a podridão é dura, de coloração marrom-escura. O ataque severo provoca grande desfolha e podridão dos frutos.

O sintoma característico da doença é a presença de manchas pequenas, circulares, esbranquiçadas, com pontuações negras (picnídios) no centro da lesão nas folhas. O fungo infecta inicialmente as folhas mais velhas. Ataques severos causam também lesões nas hastes, pedúnculo e cálice; porém, os frutos permanecem sadios.